Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms