Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2al3Q9D4U4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al3Q9D4U4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms