Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms