Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcc1Q9D4H2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms