Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt20Q9D312 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms