Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ube2cQ9D1C1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ube2cQ9D1C1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ube2cQ9D1C1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ube2cQ9D1C1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ube2cQ9D1C1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ube2cQ9D1C1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ube2cQ9D1C1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ube2cQ9D1C1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2cQ9D1C1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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