Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nde1Q9CZA6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms