Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms