Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim13Q9CYB0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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