Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc8Q9CYA6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc8Q9CYA6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms