Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtpbp8Q9CY28 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gtpbp8Q9CY28 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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