Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgo1Q9CXH7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sgo1Q9CXH7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Sgo1Q9CXH7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Sgo1Q9CXH7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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