Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prdm5Q9CXE0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prdm5Q9CXE0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prdm5Q9CXE0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prdm5Q9CXE0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prdm5Q9CXE0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prdm5Q9CXE0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Prdm5Q9CXE0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Prdm5Q9CXE0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Prdm5Q9CXE0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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