Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx10Q9CWT3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx10Q9CWT3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms