Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cnot11Q9CWN7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cnot11Q9CWN7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms