Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2310003L06RikQ9CV82 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2310003L06RikQ9CV82 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms