Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl28Q9CR40 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms