Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PsenenQ9CQR7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PsenenQ9CQR7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms