Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms