Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQM1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CQM1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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