Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nicn1Q9CQM0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nicn1Q9CQM0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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