Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQC3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms