Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms