Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atg3Q9CPX6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms