Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ino80bQ99PT3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ino80bQ99PT3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms