Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NsmfQ99NF2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NsmfQ99NF2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NsmfQ99NF2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NsmfQ99NF2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NsmfQ99NF2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NsmfQ99NF2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NsmfQ99NF2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NsmfQ99NF2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NsmfQ99NF2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms