Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmp1Q99KU0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms