Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf34Q99KR6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms