Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms