Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps4Q99KG7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms