Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pacsin3Q99JB8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms