Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms