Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbox1Q924Y0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbox1Q924Y0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms