Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smc6Q924W5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms