Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b5Q923D4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sf3b5Q923D4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b5Q923D4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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