Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Med28Q920D3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Med28Q920D3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms