Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Synpo2Q91YE8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms