Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims2Q91XD2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms