Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn4Q8VCH8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms