Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mkl1Q8K4J6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mkl1Q8K4J6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mkl1Q8K4J6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mkl1Q8K4J6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mkl1Q8K4J6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mkl1Q8K4J6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkl1Q8K4J6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms