Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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