Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ssh3Q8K330 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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