Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms