Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrrdQ8K2M3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrrdQ8K2M3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms