Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc12Q8K2L8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms