Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms