Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Abcf3Q8K268 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Abcf3Q8K268 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Abcf3Q8K268 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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