Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pacs1Q8K212 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pacs1Q8K212 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pacs1Q8K212 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pacs1Q8K212 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pacs1Q8K212 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pacs1Q8K212 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pacs1Q8K212 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pacs1Q8K212 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs1Q8K212 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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