Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms