Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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FgbQ8K0E8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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FgbQ8K0E8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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FgbQ8K0E8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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FgbQ8K0E8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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